星空防卫队全集讲述的是元二千多年时，地球陷入了空前的危机。无数的慧星从太阳系通过，而且在不久的将来将会墬落到地球，地球也将会可能会受到很大的伤害。为此，人类设立了行星危机管理机构，在卫星轨道上也设立了慧星迎击基地，同时也开始了去除对地球有威胁的行星。在迎击部队中最令人注目的就是将驾驶配备有特殊ミサイル的宇宙迎击机参加下次慧星破坏行动的驾驶员的到达。他们也被叫做 コメットブラスター，他们这些人的存在也渐渐为人所知。
地球各地路续建起了好几个超高度迎击基地。在地球上有一个基地是专门给有配备特殊ミサイル迎击部队－メテオスイーパー所使用的，这个迎击部队主要就是要消灭在宇宙中没被粉碎的巨大碎片。在这个基地中同时也有一些训练设施给想成为コメットブラスター，进而取得在宇宙工作资格愿望的人。
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